L'histoire se déroule vers la fin du xixe siècle. Deux jeunes orphelins, Flora et Miles, sont sous la tutelle de leur oncle. Ce dernier, fort occupé, les expédie à Bly, un manoir de la campagne anglaise, avec leur femme de chambre. Une femme accepte alors, non sans craintes, d'être la gouvernante des enfants avec la condition expresse de ne jamais déranger leur oncle qui vit à Londres.
Peu à peu, des évènements étranges surviennent et des inconnus semblent rôder sur le domaine. L'ancien valet et l'ancienne gouvernante, tous deux morts dans des conditions mystérieuses, hantent Bly et ont une influence néfaste sur les enfan