Arthur Fagen nació en Nueva York donde comenzó sus estudios de dirección con Laszlo Halasz. Continua su educación en la Wesleyan University y en el Curtis Institute bajo la guía de Max Rudolf. Posteriormente se traslada a Europa, donde sigue su formación en el Mozarteum de Salzburgo y con Hans Swarowsky. Arthur Fagen fue el ganador del primer premio del Concurso de Directores de la Orquesta Sinfónica de Baltimore así como del galardón del Concurso Internacional de Directores Gino Marinuzzi en Italia.

Comenzó su carrera de director como asistente de Christoph von Dohnanyi en la Ópera de Frankfurt y posteriormente de James Levine en el Metropolitan de Nueva York. Más tarde fue nombrado director principal de las Orquesta de Kassel y Braunscheweig y titular de las Sinfónicas de Amberes y Gante.

Su repertorio como director de ópera abarca más de sesenta títulos y desde el principio de su carrera ha dirigido diferentes producciones en la Opera de Chicago (Los fantasmas de Versalles de Corigliano y Don Carlo), Metropolitan de Nueva York (Il Trovatore), Staatsoper de Berlin (Aída, Cavalleria Rusticana y Pagliacci), New York City Opera (Martha y La fanciulla del West), Teatro Massimo de Palermo (Alcina), Ópera de Burdeos (Rigoletto), Ópera de Frankfurt (Un ballo in maschera), Staatstheater Stuttgart (Tosca), New Israeli Opera (La Traviata), Florencia (Die Zauberflöte, Il Barbiere di Seviglia, Carmen), Nueva Orleans y Hawai (Le Nozze di Figaro) y Festival de Spoleto (The Rake’s Progress).

Arthur Fagen disfruta de una intensa actividad como director de ópera y de concierto en Europa y Norteamérica. Ha sido Director musical de prestigiosas orquestas y teatros de ópera en Europa, siendo la última la Ópera y la Orquesta Sinfónica de Dortmund, con la cual inauguró con la Tercera Sinfonía de Mahler y Violetta Urmana el Dortmund Concert Hall. Destacamos además conciertos y representaciones con la Orquesta de la Radio de Munich, Filarmónica Eslovaca, Orquesta Nacional de México, Orquesta de la Ópera de Viena, Orquesta del Teatro San Carlos de Nápoles, Filarmónica Checa, Orquesta del Festival Primavera de Praga, Orquesta Sinfónica de Jerusalén, Tel-Aviv, Filarmónica de Tokio, Deutsche Kammerphilharmonie, Filarmónica de Baltimore, Indianapolis, Orquesta de la Radio de Noruega, Orquesta de la RAI de Turín, Milán, Roma, Nápoles, Orquestas de Génova, San Remo, Bolzano, Orquesta de la Radio de Holanda, Teatro Colon de Buenos Aires, Filarmónica de Bergen y las Óperas de Portland, Madrid, Tenerife, Oviedo, etc. y aclamadas producciones de ópera de Ariadne auf Naxos en Bolzano y Lucca, Italia, dos ciclos Der Ring des Nibelungen de Wagner en Dortmund, Un Ballo in Maschera en Cagliari. En el 2007 inauguró el ciclo de óperas y la nueva sede de la Opera de Atlanta con Turandot.

Actualmente es Director Principal de la Opera de Atlanta. En las últimas temporadas ha dirigido en los Estados Unidos Fidelio de Beethoven, Akhnaten de Glass, Der Fliegende Holländer de Wagner y Die Zauberflöte de Mozart. Estuvo al frente de la NDR Hannover en Braunschweig y al Festival Schleswig-Holstein en Alemania y fue invitado a dirigir en otros paises europeos (Italia, Suiza, España, Polonia) y en Sudamérica.

Su actividad discográfica incluye, entre otros, un CD de arias de Rossini para BMG, música de Martinu y Mc Dowell para Naxos, y las Rapsodias Húngaras de Liszt para Naxos con la Staatkapelle Weimar. Ha grabado ademas para Bayerischer Rundfunk, SFB y WDR Cologne. Colabora regularmente con Naxos, con quienes grabo las seis sinfonías de Bohuslav Martinu, y todos los conciertos para piano de este compositor, album que ha sido premiado por Gramophone Magazine en marzo 2010.

Enseña Dirección Instrumental en la Indiana University Jacobs School of Music en Bloomington.