Es wurde am 10. Oktober 1856, dem Datum des 26. Geburtstages der Königin Isabel II de España, eingeweiht. Die Architekten waren Jerónimo de la Gándara und José María Guallart y Sánchez. Dank der Initiative der spanischen Lyrik-Gesellschaft wurde das Teatro de la Zarzuela sehr schnell zu einem bedeutenden Haus für die Aufführung von Zarzuelas.

Nach einem Großbrand im Jahre 1909 musste das Gebäude fast vollständig wieder aufgebaut werden und konnte erst 1914 wieder eröffnet werden. Im Jahr 1998, vier Jahre nach der Erklärung zum Baudenkmal (Bien de Interés Cultural), wurde das Gebäude renoviert und umgebaut.

Der hufeisenförmige Zuschauerraum, einschließlich der drei Etagen mit Logenplätzen, verfügt über 1242 Sitzplätze. Die Theater-Bar befindet sich im ersten Stock im Bereich der Lobby. Das Gebäude hat keinen Aufzug zwischen den Stockwerken.